南京口岸開展基因組測序檢測，發現全新環狀新病毒
從江蘇出入境檢驗檢疫局(以下簡稱江蘇檢驗檢疫局)了解到,近日，該局聯合江蘇省衛生和計劃生育委員會(以下簡稱江蘇省衛生計生委),在對一例經南京口岸入境既往發熱患者的生物樣本進行病毒宏基因組測序檢測時,發現了一種全新的感染人體的環狀病毒。
病毒的發現及研究對防治人類和動植物疾病等各方面具重要意義
據悉,這位男性患者是一名從新加坡回國的勞務人員,在經南京祿口國際機場入境時,紅外體溫監測儀顯示其體溫超過37℃。南京檢驗檢疫局口岸檢疫人員復測確認該男子處于發熱狀態,立即對其進行了詳細的流行病學調查和醫學排查,并在知情同意后采集了血液、尿液、唾液等生物學樣本。經口岸現場快速篩查和江蘇國際旅行衛生保健中心實驗室病原體檢測,排除了其感染寨卡病毒、黃熱病毒、登革熱病毒、瘧原蟲、西尼羅熱病毒和基孔肯雅熱病毒等多種病原體的可能。
近期,江蘇檢驗檢疫局與江蘇省衛生計生委聯合對口岸既往多份發熱患者的生物樣本進行宏基因組測序檢測,在上述患者的生物樣本中發現了一種新型環狀單鏈DNA病毒片段,通過進一步測序、序列組裝、PCR擴增,得到完整的病毒基因組。該病毒基因組全長由3018個核苷酸組成,編碼2個主要蛋白。經與現有基因庫比對,與該病毒[much]相似的為豬糞相關的環狀病毒-5(PoSCV5),但其核苷酸同源性僅為84%,氨基酸同源性低于50%。經過專家復核,認為這是一種在人體首次檢出的新型環狀單鏈DNA病毒。
對于該病毒的致病性,江蘇國際旅行衛生保健中心孫立新博士表示,目前還不能明確該環狀病毒與患者所患疾病的關聯性。病毒結構與致病性不存在特別關系,不能僅從環狀來判斷它的致病性有無及強弱;相關性需要做進一步研究才能確定。
目前,江蘇國際旅行衛生保健中心和江蘇省疾病預防控制中心正在對該病毒進行分離培養,以進一步開展其生物學特征、流行病學特點、可能的致病性等研究,并繼續隨訪該患者及其家屬和相關人員,適時進行詳細的流行病學調查和生物樣本檢測工作。
據權威人士介紹,病毒在自然界分布廣泛,但直到19世紀末,病毒才開始逐漸被發現和鑒定。目前,國際病毒分類委員會(ICTV)報告認可的病毒有數千種。病毒的發現及研究對防治人類和動植物疾病,以及對分子生物學、細胞生物學、疫苗研制及基因工程等都具有重要意義。
攜手構建全鏈條的口岸傳染病防控體系
出入境人員衛生檢疫是檢驗檢疫核心工作之一,直接關系公共衛生安全。江蘇檢驗檢疫局構建了疫情風險評估、現場檢疫查驗、實驗室檢測、信息通報、后續追蹤全鏈條的口岸傳染病防控體系。
在口岸一線,檢驗檢疫部門遵循“逢警必處、科學檢疫”的旅客檢疫規則,做到不同航線飛機分類管理,風險防控,嚴格檢疫,科學處置,保證快速通關又有效維護口岸安全;同時加強與口岸部門合作,確保口岸疫情及時得到理想中處置。江蘇局著力提升技術支撐能力,打造全國系統力爭上游的口岸衛生監測技術平臺,高水平的實驗室和專業的檢測人員,為一線工作提供了有力的技術支撐,實現“檢得出、檢得準、檢得快”。
